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在药物研发场景中如何应用OpenMed加速化合物筛选?

2025-08-20 301

药物发现AI工作流构建

针对药物研发的三大核心环节提供解决方案:

  • 文献挖掘
    1. 使用OpenMed-NER-Chemical系列提取PubMed文献中的化合物
    2. 搭配Relation Extraction模型构建作用关系网络
    3. 示例:从”瑞德西韦可抑制SARS-CoV-2蛋白酶活性”中提取药物-靶点对
  • 试验数据分析
    • 处理电子实验记录(ELN)时,用OpenMed-NER-Dosage识别浓度数据
    • 实体链接技术将”5-FU”标准化为”氟尿嘧啶”
  • 知识图谱构建
    from openmed import build_kg
    kg = build_kg(research_papers, 
                entity_types=['CHEMICAL','GENE','DISEASE'],
                model='OpenMed-NER-MultiDetect-434M')

辉瑞团队案例显示,采用OpenMed的化合物识别流程后,文献筛选效率提升40%,新药靶点发现周期从6个月缩短至3个月。关键是在流水线中集成OpenMed/OpenMed-NER-ADMET-290M模型预测化合物性质。

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