A função de geração de sequência de DNA do Evo 2 é simples, mas poderosa, conforme descrito abaixo:
Processos operacionais:
- Modelos de carregamento::
from evo2 import Evo2
model = Evo2('evo2_7b') # 使用7B参数模型 - Digite os prompts e gere::
prompt = ["ACGT"] # 初始DNA序列
output = model.generate(prompt_seqs=prompt, n_tokens=400, temperature=1.0, top_k=4)
print(output.sequences[0]) # 输出400个核苷酸序列
Descrição do parâmetro:
n_tokens: controla o comprimento da sequência geradatemperatureControle de aleatoriedade (recomendado 0,8-1,2)top_kLimitar a faixa de amostragem para otimizar a qualidade dos resultados
As sequências geradas podem ser usadas diretamente para a bioanálise downstream ou como ponto de partida para um projeto adicional.
Essa resposta foi extraída do artigoEvo2: uma ferramenta de bioinformática de código aberto para apoiar a modelagem e o design de genomasO
Não pode ser reproduzido sem permissão:Ferramentas de produtividade de IA " Como faço para gerar uma sequência de DNA usando o Evo 2?
