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怎样提升BRCA1基因变体效应预测的准确性?

2025-09-05 1.8 K

高精度变体分析的实现路径

基于Evo 2实现高可信度变体预测需关注三个关键环节:

  1. 数据预处理阶段::
    • 使用UCSC Genome Browser获取完整BRCA1参考序列(约10kb)
    • 通过BWA工具对变体序列进行多重比对,确保输入为标准化FASTA格式
  2. 模型调优阶段::
    • 选择40B参数模型(加载指令:Evo2('evo2_40b'))
    • anpassentemperature=0.3Reduzierte Zufälligkeit
    • aufstellentop_k=2限制采样空间
  3. 结果验证阶段::
    • 结合ClinVar数据库已知致病突变进行交叉验证
    • 使用Goodfire可视化工具分析特征激活模式

注意事项:对关键临床变体建议运行5次重复实验,取score均值作为最终预测值

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