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Wie kann man schnelles Transferlernen von genomischen Merkmalen auf andere Arten erreichen?

2025-09-05 2.0 K

Technische Wege für die bereichsübergreifende Wissensmigration

Speziesübergreifende Modellierung unter Verwendung des OpenGenome2-Datensatzes von Evo 2:

  1. grundlegende Vorbereitung::
    • Download enthält über 300 ArtenOpenGenome2.jsonlDatensatz
    • Installieren Sie das Savanna-Framework:pip install savanna-core
  2. Feinabstimmungsstrategie::
    • Frieren Sie die zugrunde liegenden Parameter ein:freeze_layers: [0-25]
    • Anpassung der Lernraten:lr=5e-5
    • Konfigurieren Sie den Kopf der Artenklassifizierung:
      cross_attention_heads: 8
  3. Validierungsmethoden::
    • K-fache Kreuzvalidierung verwenden (k=5 empfohlen)
    • Berechnung des Bereichsanpassungsindex DAI > 0,85, um den Erfolg der Migration zu ermitteln

Typische Anwendung: Bei der Migration von BRCA1-Wissen aus dem menschlichen Genom in ein Mausmodell wird eine progressive Auftau-Strategie empfohlen (5 Schichten pro 10epoch, beginnend von oben)

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