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Was muss ich beachten, wenn Evo 2 Sequenzen mit einer Länge von bis zu 1 Million Basen verarbeitet?

2025-09-05 1.8 K

Obwohl Evo 2 die Verarbeitung von sehr langen DNA-Sequenzen unterstützt, sollten für eine optimale Leistung die folgenden Punkte beachtet werden:

Hardware-Konfiguration:

  • Empfohlenes parametrisches 40B-Modell (erfordert Multi-GPU-Unterstützung)
  • Der Grafikspeicher muss groß genug sein, empfohlen werden nicht weniger als 40 GB pro GPU

Optimierungsstrategien:

  • chunkingAufteilung der Sequenz in mehrere Blöcke, die nacheinander abgearbeitet werden
  • LehreraufforderungEinsatz der Lehrerführungstechnologie zur Verbesserung der Effizienz
  • Niedrigere TemperaturVerringerung des Rechenaufwands und Erzielung stabilerer Ergebnisse

Leistungsüberwachung:

  • ausnutzennvidia-smiGPU-Nutzung überwachen
  • Überprüfen des Multi-GPU-Zuweisungsstatus des Vortex-Frameworks

Bitte beachten Sie, dass die Vorwärtspropagierung langer Sequenzen derzeit sehr zeitaufwändig ist, und es wird empfohlen, sie in einer nicht produktiven Umgebung zu testen, bevor Sie umfangreiche Berechnungen durchführen.

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