Obwohl Evo 2 die Verarbeitung von sehr langen DNA-Sequenzen unterstützt, sollten für eine optimale Leistung die folgenden Punkte beachtet werden:
Hardware-Konfiguration:
- Empfohlenes parametrisches 40B-Modell (erfordert Multi-GPU-Unterstützung)
- Der Grafikspeicher muss groß genug sein, empfohlen werden nicht weniger als 40 GB pro GPU
Optimierungsstrategien:
- chunkingAufteilung der Sequenz in mehrere Blöcke, die nacheinander abgearbeitet werden
- LehreraufforderungEinsatz der Lehrerführungstechnologie zur Verbesserung der Effizienz
- Niedrigere TemperaturVerringerung des Rechenaufwands und Erzielung stabilerer Ergebnisse
Leistungsüberwachung:
- ausnutzen
nvidia-smi
GPU-Nutzung überwachen - Überprüfen des Multi-GPU-Zuweisungsstatus des Vortex-Frameworks
Bitte beachten Sie, dass die Vorwärtspropagierung langer Sequenzen derzeit sehr zeitaufwändig ist, und es wird empfohlen, sie in einer nicht produktiven Umgebung zu testen, bevor Sie umfangreiche Berechnungen durchführen.
Diese Antwort stammt aus dem ArtikelEvo2: ein quelloffenes Bio-AI-Tool zur Unterstützung von Genommodellierung und -designDie