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在微生物工程场景中如何应用Evo2设计新型DNA序列？

2025-09-05

1.8 K

微生物基因设计的全流程方案

针对微生物工程的特殊需求，可按以下步骤实现定制化DNA设计：

物种适配：在输入prompt中加入特定微生物标识符，如
```
"[E.coli]ACGT"
```
会引导模型生成大肠杆菌偏好性密码子
功能约束：通过添加注释引导设计：
```
"[promoter:strong][CDS]ATG"
```
可确保生成带强启动子的编码序列
物性优化：结合以下参数控制生成结果：
- gc_content=0.55调节GC比例
- repeat_threshold=3避免重复序列

典型案例：设计枯草芽孢杆菌分泌蛋白时，建议先使用model.score_sequences()评估200条候选序列，再选择top5进行后续实验验证

この答えは記事から得たものである。Evo2: ゲノムモデリングとデザイン支援のためのオープンソースバイオAIツールについて

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