ドメイン知識の構築
研究者は、1)生物医学文献から遺伝子と疾患の関連を抽出し、2)法医学的概念のシステムを自動的に構築し、3)論文間の学術的引用のネットワークを構築することができる。あるグループはこれを用いて300の臨床報告を処理し、3日間で新しい冠治療のナレッジグラフを構築した。
具体的な実施ステップ
- PDF形式の論文集を準備する
- 分野別オントロジーの構成(MeSH医学主題見出しなど)
- うごきだす
uv run ontocast process --input papers/ --output research.ttl - BRCA1遺伝子と相互作用するタンパク質」のような複雑な質問をSPARQLで問い合わせる。
拡張アプリケーションの方向性
Jupyter Notebookと組み合わせることで、1)ナレッジ・マッピングの動的可視化、2)書誌分析、3)レビュー・レポートの自動生成、を実現できる。システムから出力されたRDFデータは、VOSviewerなどの分析ツールに直接インポートすることができる。
この答えは記事から得たものである。OntoCast: ドキュメントから意味的トリプルを抽出するインテリジェントなフレームワークについて































