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Evo 2が100万塩基までの塩基配列を処理する場合、どのような点に注意する必要がありますか?

2025-09-05 2.0 K

Evo 2は非常に長いDNA配列の処理をサポートしていますが、最適なパフォーマンスを得るためには以下の点に注意する必要があります:

ハードウェア構成:

  • 推奨40Bパラメトリックモデル(マルチGPU対応が必要)
  • グラフィック・メモリは十分な容量が必要で、GPUあたり40GB以上を推奨する。

最適化戦略:

  • チャンキングシーケンスを複数のブロックに分割し、順次処理する。
  • ティーチャープロンプティング効率向上のための教師用プロンプト・テクノロジーの活用
  • より低い温度計算負荷を軽減し、より安定した結果を得る。

パフォーマンス・モニタリング:

  • 利用するnvidia-smiGPUの使用状況の監視
  • VortexフレームワークのマルチGPU割り当て状況の確認

現在、長いシーケンスの順伝播は時間がかかるので、大規模な計算を行う前に、非生産環境でテストすることをお勧めします。

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